Análise de ADN forense: Fluxos de trabalho de sequenciação maciçamente paralela

A sequenciação maciçamente paralela (MPS) oferece uma solução para os maiores desafios enfrentados pelos métodos de EC, tais como distinguir a verdadeira variação alélica dos artefactos de PCR, interpretar misturas e obter perfis utilizáveis a partir de ADN degradado. No entanto, a adoção de uma nova tecnologia pode ter desafios únicos. A família de produtos PowerSeq® pode ajudar a tornar a transição mais suave.

Os produtos PowerSeq® permitem a amplificação alvo da região de controlo mitocondrial e de sequências mitocondriais completas. Além disso, os produtos PowerSeq® podem amplificar repetições curtas em tandem (STRs) no cromossoma Y e no ADN autossómico para preparar bibliotecas de sequenciação Illumina® para análise MPS.

Sistema PowerSeq® Whole Mito

Fluxo de trabalho simplificado para uma análise completa do mtDNA

O sistema PowerSeq® Whole Mito gera 161 pequenos amplicons que abrangem toda a região do genoma mitocondrial. As regiões-alvo para amplificação foram concebidas para um tamanho médio de 167 pb, de modo a garantir resultados óptimos a partir de amostras degradadas. O sistema contém reagentes para a preparação de bibliotecas e um fluxo de trabalho optimizado que reduz significativamente o número de passos e o tempo necessário para produzir bibliotecas prontas para sequenciação.

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Sistema aninhado PowerSeq® CRM, personalizado

Preparação simplificada de bibliotecas para análise de mtDNA

O PowerSeq® CRM Nested System, Custom, gera 10 pequenos amplicons que cobrem a região de controlo do genoma mitocondrial numa única reação multiplex. Esta técnica melhora os resultados de amostras degradadas. O fluxo de trabalho simplifica muito a preparação da biblioteca, poupando tempo, diminuindo a perda de amostras e reduzindo a variabilidade dos dados.

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Sistema PowerSeq® 46GY

Painel optimizado de loci para análise STR

O sistema PowerSeq® 46GY oferece a mesma sensibilidade que os kits de amplificação STR. Pode ser utilizado para preparar bibliotecas MPS e gerar dados de sequenciação compatíveis com a tecnologia de sequenciação Illumina®. O kit permite a identificação de variantes de sequência em loci autossómicos e Y-STR conhecidos, de modo a que os dados gerados sejam utilizáveis e interpretáveis de acordo com as directrizes actuais.

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Sistema PowerSeq® Quant MS

Preparação consistente de bibliotecas para análise de STR

O sistema PowerSeq® Quant MS é um sistema baseado em qPCR concebido para a quantificação de bibliotecas antes da sequenciação no sistema Illumina® MiSeq®. A quantificação exacta da biblioteca proporciona uma representação equilibrada das bibliotecas agrupadas e reduz a tendência de sequenciação.

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Coming in 2026: IDseek® MPS Library Prep Kits from NimaGen

The only forensic MPS library prep powered by RC-PCR technology, making it as simple as a single PCR amplification.

We have partnered with NimaGen B.V. to bring the IDseek® MPS library prep portfolio to forensic casework laboratories worldwide. NimaGen’s patented RC-PCR, a combining multiplex PCR amplification, adapter ligation and indexing all in a closed, one-tube reaction. After RC-PCR amplification, samples are pool-purified and size-selected using AmpliClean™ Magnetic Bead Cleanup, providing sequencing ready libraries. This streamlined workflow significantly reduces hands-on time and minimizes risk of pipetting errors, sample swapping and contamination.

Key advantages of IDseek® RC-PCR library preparation:

  • One closed-tube, single reaction workflow with simultaneous indexing and target amplification
  • Improved specificity and sensitivity from low starting primer concentrations, enabling use of low-quantity and degraded DNA samples
  • Single pool library purification for equal-input sample sets, reducing time and consumable costs
  • Library Normalization Kits for optimized sample-to-sample read depth distribution across mixed-quantity and mixed-quality samples

The IDseek® portfolio spans more than 20 products across seven product families, supporting applications including:

  • Autosomal STR profiling (IDseek® OmniSTR™)
  • Y-chromosomal STR profiling (IDseek® mYSTR™)
  • Combined autosomal and Y-chromosomal STR profiling (IDseek® CombiSTR™ Plus)
  • Microhaplotype analysis (IDseek® OmniHAP™)
  • Identity informative SNP typing (IDseek® OmniSNP™)
  • Mitochondrial DNA sequencing (IDseek® Mitochondrial HVR and Full Genome kits)
  • Library Purification (AmpliClean™ Cleanup Kit, Magnetic Beads)
  • Indices addition (Unique Dual Index Primer Plates)

These products are not yet available for purchase on our website. To be notified when IDseek® products become available, or to speak with one of our forensic specialists about MPS adoption, contact us.

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Sequenciação maciçamente paralela para análise de ADN forense

Tradicionalmente, a eletroforese capilar (CE) tem sido o método de eleição para a análise de repetições curtas em tandem (STR) para identificação humana. Embora os métodos de EC continuem a evoluir em termos de aumento da sensibilidade e da capacidade de trabalhar com ADN degradado ou de má qualidade, a técnica ainda enfrenta alguns desafios.

A sequenciação de nova geração (NGS), ou sequenciação maciçamente paralela (MPS), permite a análise simultânea de centenas de marcadores genéticos, consideravelmente mais do que as actuais tecnologias de EC. Para além de fornecer informações sobre o tamanho das regiões repetidas, como faz a EC, a MPS determina a sequência de ADN subjacente de cada região. Ao fazer isso, a MPS oferece uma solução para os maiores desafios enfrentados pelos métodos de EC, como distinguir a verdadeira variação alélica dos artefatos de PCR, interpretar misturas e obter perfis utilizáveis de DNA degradado.

Uma aplicação popular das MPS na área forense é a sequenciação de ADN mitocondrial - quer a região de controlo variável, quer todo o genoma mitocondrial - com maior deconvolução de misturas e resolução de heteroplasmia em comparação com os métodos tradicionais. Embora a adoção de fluxos de trabalho MPS pelos laboratórios forenses tenha sido lenta, a tecnologia é muito promissora para aumentar a precisão e o rendimento da análise do ADN forense. Os futuros avanços na MPS para baixar ainda mais o custo incentivarão uma adoção mais generalizada e a consequente validação dos métodos forenses de MPS.